2. Мастер-ключ в данной конструкции не используется. В принципе, его можно добавить, уменьшив количество остальных ключей до 14 и выделив под него область EEPROM, защищённую от записи и стирания. В этом случае его можно или записать непосредственно в EEPROM при программировании или придумать какую-либо сложную комбинацию нажатия кнопок для входа в режим его записи или стирания. Однако, если предполагается, что бы пользователь ни коим образом не удалил "универсальный" ключ, первый вариант предпочтительнее.

Теперь ещё два момента.
=================
1. Судя по схеме на резервный аккум. непрерывно подаётся напряжение около =14V, на мой взгляд это недопустимо. Если использовать простой (без "умной" схемы подзаряда) аккум. то необходимо подключать его через диод, исключив тем самым зарядку аккума от схемы. В этом случае аккум. придётся заряжать отдельно и за состоянием его заряда следить самостоятельно.

2. Михаил, вы сможете добавить в программу выход который отражал бы состояние схемы 1-ОХРАНА ВКЛ. 0-ОХРАНА ОТКЛ. (использовать выв.3 или 9 микросхемы, лучше 3) ?

А по 2-му вопросу, прошу не сердиться, поясняю:
светодиод есть, однако в некоторых режимах он мигает, я же говорю о том, что когда девайс в режиме охрана на одном из выходов торчит 1, когда снят с охраны или нарушение шлейфа - 0. (это может пригодиться для расширения функционала)

И ещё одна мыслишка, на один из незадействованных выходов вывести сигнал распознавания "родного" ключа, примерно 30 сек. импульс 0-1-0. В этом случае девайс приобретает новый функционал - контроль доступа (СКУД). Естественно при небольшой доработке принципиальной схемы.

На счёт авторских, никаких противоречий не вижу. Считаю, что автор вправе распоряжаться своим творением по своему усмотрению.
И это правильно

Далее посмотрите, что выдаёт микроконтроллер с вывода 8 ТХ. Для этого его можно подключить на СОМ порт через преобразователь уровня на МАХ232 и запустив терминальную программу.

И последнее - SMS необходимо сохранять именно на SIM карте, а не в памяти телефона!